天然に存在する抗菌ペプチドは、通常、30 個を超えるアミノ酸残基から構成される小さな塩基性ポリペプチドです。これらは水溶性であり、分子量は約 4,000 ダルトンです。-ほとんどの抗菌ペプチドは熱安定性があり、100 度で 10 ~ 15 分間加熱した後でも活性を維持します。大部分は 7 を超える等電点を持ち、強いカチオン特性を示します。さらに、高いイオン強度や極端な pH に対しても顕著な耐性を示します。一部は、トリプシンやペプシンなどの酵素による加水分解に抵抗する能力も備えています。

現在の研究では、抗菌ペプチドの殺菌メカニズムには主に細菌の細胞膜を標的とすることが関与していることが示唆されています。それらは膜の完全性を破壊し、細孔を形成し、細胞内内容物の漏出とその後の細胞死を引き起こします。このプロセスは通常、細菌の膜表面への静電引力から始まり、続いて疎水性 C- 末端が膜の疎水性領域に挿入され、膜の立体構造が変化します。次に、複数のペプチドが膜内にイオンチャネルを形成し、特定のイオンの流出を引き起こし、細胞死を引き起こします。他の研究者は、これらのペプチドが膜タンパク質と相互作用し、-凝集、不活化、イオン チャネルの形成を引き起こし-、それによって膜透過性が変化し、死に至ると考えています。特定の膜受容体の存在や他の因子の潜在的な相乗効果に関しても疑問が残っています。作用機序は、抗菌ペプチドのクラスによって異なる場合があります。